Microbioma

Il Core Microbioma della Fondazione EBRIS è attivamente impegnato nella caratterizzazione dei complessi meccanismi di azione attraverso cui il microbiota influenza l’insorgenza e la progressione di patologie di varia afferenza clinica, con particolare focus sulle malattie infiammatorie croniche, i disturbi di salute mentale, e le malattie genetiche rare.

Lo scopo ultimo che accomuna le nostre linee di ricerca è volto a migliorare le attuali strategie di prevenzione e di identificare biomarcatori microbici clinicamente rilevanti per sviluppare percorsi diagnostici e terapeutici personalizzati, promuovendo l’avanzamento verso la medicina di precisione.

Hai bisogno di sequenziamento NGS e analisi del microbioma accurati e affidabili? Se desideri servizi di sequenziamento e analisi del microbioma, il nostro team è pronto a collaborare con te per offrirti soluzioni personalizzate progettate insieme per soddisfare i tuoi obiettivi di ricerca.

FOCUS ATTIVITÀ LABORATORIO

Il programma di ricerca per il triennio 2024-2027 si articola in tre aree tematiche:

Neuroscienze:

• Horizon 2022_ OPADE project (https://opade-project.eu). Il progetto OPADE si concentra sullo studio dell’asse intestino-cervello nella depressione maggiore. Lo studio ha l’obiettivo di identificare biomarcatori precoci di patologia e risposta ai farmaci e di sviluppare e commercializzare uno strumento predittivo basato su algoritmi di Intelligenza Artificiale utile a support il processo decisionale dei professionisti sanitari.
  ClinicalTrials.gov ID NCT06550037
• Horizon 2020_GEMMA project (https://www.gemma-project.eu/it). Il consorzio di ricerca GEMMA mira a raggiungere una migliore comprensione dei sintomi correlati allo spettro autistico e della sua comorbidità con disturbi gastrointestinali.
  ClinicalTrials.gov ID NCT04271774
• Department of Mental Health of Salerno, Italy_Biomarkers identification in anorexia nervosa. Il progetto è basato sull’identificazione di biomarcatori microbici salivari ed intestinali collegati allo stress in pazienti affetti da anoressia nervosa.

Malattie autoimmuni:

• NIH CDGEMM (https://www.massgeneral.org/children/celiac-disease/studio-genomico-ambientale-microbiomico-e-metabolico-nella-malattia-celiaca). Questo studio segue i bambini dalla nascita durante l’infanzia con il fine di identificare quali fattori contribuiscano allo sviluppo della celiachia, con particolare focus al microbiota intestinale.
  ClinicalTrials.gov ID NCT02061306

Malattie genetiche rare:

• Regione Campania MiCrO_Care. Il progetto prevede di studiare come la composizione del microbiota intestinale possa influenzare il fenotipo clinico di due malattie rare: la Sindrome Kabuki e la Sindrome di DiGeorge. Entrambe, infatti, sono caratterizzate da mutazioni che stravolgono il normale meccanismo di regolazione epigenetica. Il nostro obiettivo è di capire se la manipolazione del microbiota possa diminuire la severità della malattia da un punto di vista epigenetico.

Service microbioma

Il Core Microbioma offre servizi di sequenziamento del microbioma a partire da matrici biologiche quali feci e saliva. Il sequenziamento del 16S rRNA, utile a profilare la composizione microbica, è un approccio economico e adatto per studi su larga scala. La metagenomica Shotgun, invece non solo permette la valutazione della diversità microbica dei campioni analizzati ma, catturando l’intero genoma batterico, fornisce informazioni funzionali non reperibili con i metodi basati sugli ampliconi.

Il nostro laboratorio segue gli standard UNI EN ISO 9001. Con attrezzature all’avanguardia e protocolli validati, forniamo risultati di sequenziamento rapidi e accurati. Inoltre, il nostro team di bioinformatica è a disposizione per offrire supporto personalizzato, guidandoti nell’interpretazione dei dati.

EQUIPMENT

Strumentazione NGS

Il nostro laboratorio è dotato del sistema di sequenziamento Nextseq 1000 ILLUMINA, tra i più recenti e potenti sistemi NGS Illumina in commercio. Una piattaforma basata su una chimica avanzata ed ulteriormente ottimizzata (2024), una bioinformatica semplificata e un flusso di lavoro applicabile scalarmente alla più ampia gamma di applicazioni di sequenziamento.